《暂行办法》规定，总包单位应当在工程施工合同签订之日起30日内开立专用账户，并与建设单位、开户银行签订资金管理三方协议。专用账户名称为总包单位名称加工程建设项目名称后加“农民工工资专用账户”。同时，建设单位与总包单位订立书面工程施工合同时，应当约定工程款计量周期和工程款进度结算办法、建设单位拨付人工费用的周期和拨付日期以及人工费用的数额或者占工程款的比例，且应当满足农民工工资按时足额支付的要求。此外，总包单位有2个及以上工程建设项目的，可开立新的专用账户，也可在符合项目所在地监管要求的情况下，在已有专用账户下按项目分别管理。
工程完工、总包单位或者开户银行发生变更需要撤销专用账户的，总包单位将本工程建设项目无拖欠农民工工资情况公示30日，并向项目所在地人力资源社会保障行政部门、相关行业工程建设主管部门出具无拖欠农民工工资承诺书。但工程建设项目存在以下情况，总包单位不得向开户银行申请撤销专用账户：尚有拖欠农民工工资案件正在处理的；农民工因工资支付问题正在申请劳动争议仲裁或者向人民法院提起诉讼的；其他拖欠农民工工资的情形。
为开展组织领导专款上用工具箱，《暂行依据》除了要施工院校开展对总包院校兴办、公司注销登报上用工具箱个人帐户里的原因的督察，还要明确商业证券公司开户商业证券公司严禁不将上用工具箱个人帐户里的资金量转回除本項目农业工人工本身商业证券公司个人帐户里的其它的个人帐户里的，严禁不为上用工具箱个人帐户里的出示现钞转出和某些转账汇款结算单服务保障。为了保障人工费用的及时拨付，《暂行办法》要求建设单位应当按工程施工合同约定的数额或者比例等，按时将人工费用拨付到总包单位专用账户。人工费用拨付周期不得超过1个月。若出现未按约定拨付人工费用等情况的，开户银行应当通知总包单位，由总包单位报告项目所在地人力资源社会保障行政部门和相关行业工程建设主管部门，相关部门应当纳入欠薪预警并及时进行处置。若建设单位已经按约定足额向专用账户拨付资金，但总包单位依然拖欠农民工工资的，建设单位应及时报告有关部门。
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